个旧锡矿以矿床类型丰富著称，按产出空间和成因可划分为四大类：一是地表砂矿床，由原生锡矿经风化剥蚀、搬运富集而成；二是中三叠统地层中的层间（氧化）矿床，矿体受地层层位控制，呈似层状、叠瓦状分布；三是花岗岩接触带内的矽卡岩多金属硫化矿床，产于花岗岩与碳酸盐岩接触交代带；四是蚀变花岗岩型锡多金属矿床，产于花岗岩体内部蚀变带中，是近年来在大箐东矿段新发现的矿床类型，拓展了个旧矿区的找矿空间。大箐东矿段同时发育层间氧化矿和蚀变花岗岩型锡矿，二者在空间上上下叠置，构成“楼上楼”的成矿格局。
蚀变花岗岩型锡矿的控矿机制是大箐东矿段最具特色的地质现象。刘潇（2018）通过对395个见矿点的空间分布分析，总结出“岩体凸起边缘—断裂交汇—顶部凹槽”三位一体的控矿模式：花岗岩突起边部受北东向断裂影响，垂向上沿断裂向上侵入形成类似岩墙的突然陡立，部分区域沿地层薄弱面形成岩枝或超覆构造的岩脉倒转；突起顶部受北东向、东西向、北西向多组断裂的相互作用，形成“口字型”断裂夹持带之间的顶部凹槽，是良好的储矿空间；花岗岩凸起边部因断裂带存在而使岩体端部处于相对开放状态，岩体顶面与侧面同时与围岩接触，接触面大，应力释放和热液、热源散失快速，快速冷凝收缩导致岩体边缘产生一系列节理、裂隙，成为汽水热液蚀变交代或充填的空间，锡、铜等多金属元素在此富集成矿。
个旧矿田的金属组合分带具有明显的空间规律性。从北到南，锡矿化逐渐减少，铜矿化逐渐增加：北部马拉格、松树脚以锡为主；中部高松锡铜共生；南部老厂、卡房以富铜矽卡岩型矿化为主，往往伴随玄武岩出现。研究表明，玄武岩可能是个旧矿区铜矿化的主要物质来源，而铅、锌等贱金属主要来源于碳酸盐岩地层。当围岩包括富铜的三叠纪玄武岩时，矿化金属组合由以锡为主转变为富铜或以铜为主。这一规律对个旧矿区不同矿田的找矿方向和资源评价具有重要指导意义。
