矿床属于海相火山岩型铁矿床，具体为与火山—次火山气液有关的矽卡岩型磁铁矿矿床。磁铁矿为热液充填交代成因，而非前人认为的矿浆成因。
矿床形成于大陆边缘弧环境，大哈拉军山组火山岩为一套钙碱性系列（高钾钙碱性—钾玄岩），是受俯冲带流体交代的地幔楔部分熔融形成的岩浆经结晶分异和同化混染作用的产物。火山喷发后期，安山质凝灰岩受热变质，地层中呈星点状散布的磁铁矿发生活化迁移和富集，形成火山变质期浸染状磁铁矿矿石。岩浆演化后期，深部岩浆房处于高温负压状态，大气降水和地下水与岩浆热液混合后沿裂隙上升，在交代凝灰岩过程中Fe以氯络合物形式迁移；在晚矽卡岩阶段，由于温度下降、角闪石和绿帘石等含水矿物大量生成消耗H⁺，溶液趋于碱性、高氧逸度，Fe的氯化物络合物水解，导致磁铁矿大量沉淀，形成敦德铁矿的主体。
