黄铜矿矿石标本整体呈浅绿色调，这与斑岩型铜矿中广泛发育的绢英岩化蚀变密切相关——钾长石等暗色矿物被浅色的绢云母和石英交代后，矿石呈现出特征的浅绿灰色。矿石铜品位约0.5%，属于斑岩型铜矿典型的低品位大矿量特征，虽然单吨矿石含铜量不高，但由于矿体规模巨大，总资源量极为可观。矿石具粒状结构，矿物颗粒细小，多呈他形—半自形粒状，均匀分布于岩石基质中。在构造上，矿石以浸染状构造为主，黄铜矿、黄铁矿等金属矿物呈星散状、细点状均匀浸染于脉石矿物颗粒之间，局部可见细脉状、网脉状构造，反映了多期次热液活动叠加的特征。
矿石矿物组合以黄铁矿、黄铜矿、辉钼矿和辉铜矿为主。黄铁矿是矿石中含量最多的硫化物矿物，呈浅黄铜色，多呈立方体晶形或细粒集合体，广泛分布于各类蚀变岩石中；黄铜矿呈铜黄色，具金属光泽，是铜的主要赋存矿物，多以细粒浸染状或细脉状产出，与黄铁矿密切共生；辉钼矿呈铅灰色，具金属光泽，以片状、鳞片状集合体形式产出，是钼的主要载体，多分布于岩体深部的钾化带中，与石英脉共生；辉铜矿呈暗铅灰色，多产于近地表的次生富集带，是次生硫化物富集作用的产物。此外，矿石中还含有斑铜矿、黝铜矿、磁铁矿等矿物，以及方铅矿、闪锌矿等中低温硫化物。
脉石矿物主要为钾长石、斜长石和石英。钾长石呈肉红色或灰白色，是钾化蚀变带的标志性矿物，以细脉状或散点状分布于岩体中心部位；斜长石呈灰白色，是花岗斑岩的主要造岩矿物，在蚀变过程中常被绢云母、高岭石等黏土矿物交代；石英呈乳白色粒状或脉状，是绢英岩化带的主要矿物成分，与黄铜矿、辉钼矿等金属矿物密切共生。矿石的浅绿色调正是绢英岩化蚀变的典型表现——斜长石被绢云母和石英交代后，岩石整体颜色变浅、色调偏绿。值得注意的是，玉龙铜矿矿石类型复杂，除了原生斑岩型矿化外，还叠加了强烈的次生改造富集成矿作用，在氧化带和次生硫化物富集带中，铜品位可显著提高，形成富矿体。
