第一阶段：中寒武世矿源层形成（约 5.2 亿至 5.0 亿年前）。 滇东南地区为陆棚-滨海沉积环境，沉积了中寒武统田蓬组（滨岸潮坪相碎屑岩-碳酸盐岩）和龙哈组（潮间带白云岩）地层，锡、银、铅、锌等成矿元素在沉积过程中发生初始富集，形成具有较高成矿元素背景值的矿源层，为后期成矿提供了部分物质来源。

第二阶段：燕山晚期花岗质岩浆底辟上侵（约 68.8Ma）。 华南地区处于区域伸展构造背景，岩石圈减薄、软流圈上涌，导致地壳沉积物（泥质岩、杂砂岩）部分熔融，形成富锡、富碱的 S 型花岗质岩浆；岩浆沿 NW 向断裂底辟上侵，在白牛厂地区深部形成隐伏黑云母二长花岗岩体，同时产生一系列 NW 向张裂带和层间破碎带，为成矿流体运移和矿质沉淀提供了通道和空间。

第三阶段：接触交代与夕卡岩型锡（钨）、铜矿化。 岩浆活动末期，富含成矿流体的岩浆与围岩发生接触交代作用，在接触带形成夕卡岩型锡（钨）矿体和铜矿体；含矿流体在岩浆热驱动下，沿围岩中由岩浆作用导致的裂隙和断裂上升。第四阶段：热液向外运移与分带沉淀（主成矿期）。 含矿热液沿 NW 向断裂和层间破碎带向外运移，进入碎屑岩-碳酸盐地层，与围岩内的大气降水混合，在运移过程中萃取围岩中的 Ag、Pb 等组分；随运移距离增大，混合流体因温度、压力降低及其它物化条件改变，在有利岩性、层间破碎带、裂隙带及断裂破碎带依次沉淀出 Cu—(Zn) 矿体（距岩体 200—300m）、Zn 矿体、Zn—Pb—Ag—(Sn) 矿体（VI 号主矿体，距岩体 400m 以上）、Ag 矿体（VI 号上部边缘）和 Sb 矿体（VI 号外带），形成系统的 Sn—Cu—Zn—Pb—Ag—Sb 矿化分带；VI 号矿体内部还呈现下部富锌、上部富铅的垂向分带。

第五阶段：抬升剥露与深部找矿（约 6500 万年以来）。 区域持续隆升剥蚀，使浅部银铅锌矿体接近地表（清代即已开采银矿，残留 13 万吨炉渣），近地表形成氧化带（铅矾、白铅矿、孔雀石、褐铁矿）；大部分锡、铜矿体仍隐伏于深部。近年来按 "隐伏花岗岩控矿、矿化分带" 思路开展深部找矿，在穿心洞-鱼塘和阿尾矿段深部预测区经钻探验证，发现了厚大独立锡矿体（最厚 22.85m，品位 1.331%）、铜矿体和锌矿体，实现了找矿重大突破，也验证了白牛厂矿床作为与花岗质岩浆作用有关的超大型银（锡）多金属矿床的成矿模式。