格尔珂（大水）金矿的矿石类型繁多，是该矿床最具特色的方面之一。根据赋矿岩石和矿石特征，可将矿石分为赤铁矿化硅化碳酸盐岩型、交代似碧玉岩型（似碧玉硅质岩型）、赤铁矿化硅化花岗闪长岩型、纹层状/条带状硅质岩型、角砾岩型（包括蚀变构造角砾岩型、蚀变隐爆角砾岩型）、赤铁矿化硅化砾岩型、鲕状或豆状沉积砾岩型、蚀变碎裂白云质灰岩型以及侏罗系砾岩中脉状矿石等多种类型，其中以赤铁矿化硅化碳酸盐岩、硅质岩（似碧玉岩）、赤铁矿化硅化花岗闪长岩和角砾岩四种类型为主，分布最为广泛。矿石类型的多样性反映了大水金矿成矿环境的复杂性和多期次热液活动的叠加改造特征。矿石中的金属矿物组合以玉髓（微晶石英）-赤铁矿（褐铁矿）-自然金为核心特征组合，这是 "大水式" 金矿区别于其他类型金矿的最标志性矿物组合。除这三种主要矿物外，还含有微量的黄铁矿、黄铜矿、含铁砷黝铜矿、辰砂、雄黄、雌黄、辉锑矿、白铁矿、毒砂、白铅矿、闪锌矿等金属硫化物和硫盐矿物，但这些硫化物含量普遍很低，这也是大水金矿 "化学成分简单" 的重要体现。脉石矿物主要为石英（包括玉髓、微晶石英）、方解石、赤铁矿、褐铁矿、白云石等，其中石英和方解石是最主要的脉石矿物。
