查干敖包萤石矿为典型沉积预富集‑岩浆热液叠加改造型特大型萤石矿床。海西晚期，发生酸性火山喷发活动，富氟流体伴随火山物质沉积，在二叠统局限沉积盆地中完成氟质初步富集，为后续成矿奠定物质基础。早白垩世燕山花岗质岩浆侵入活动提供充足热力与成矿流体，含氟热液沿岩层接触带、层间破碎带及构造裂隙运移、充填、交代围岩，在有利构造空间持续沉淀富集。同时伴随硅化、碳酸盐化等围岩蚀变，不断改造矿层结构，提升矿体规模与矿石品位，形成层状、似层状主矿体及少量脉状矿体。矿床成矿兼具沉积预成矿与热液改造成矿双重特征，受控于火山沉积岩相、构造破碎带与岩浆热液叠加作用，最终形成超大型工业萤石矿床。
查干敖包萤石矿成矿模式框图（图片来源于网络）
